马其顿于2006年8月产生新政府，2007年是新政府开局之年，但由于与反对党之间摩擦不断，一度陷入信任危机。马其顿内部革命组织民族统一民主党主席尼古拉·格鲁埃夫斯基在2006年当选政府总理后，选择了规模较小的阿族民主党组成联合政府，而获得多数阿尔巴尼亚族人支持的一体化民主联盟则被排斥在政府之外，以致该党不断抗议，明确表示不支持新政府，并在2007年初以政府忽视阿族人权益为由退出议会。格鲁埃夫斯基为了安抚一体化民主联盟，使其重返议会，同意所有法案在议会通过时，既要征得议会大多数的同意，也要征得大多数阿族议员的首肯。此举遭到马其顿主要反对党社会民主党的反对，随即对现政府提出不信任案。马其顿议会为了保持新政府的稳定性，否决该议案。一体化民主联盟仍旧威胁将抵制议会。9月，在一次议会例会中，联合政府内阿族民主繁荣党的一名议员同一体化民主联盟议员大打出手，冲突继而在首都斯科普里演变成街头暴力。

2007年马其顿经济呈现健康发展趋势。国际货币基金组织预计全年GDP增长超过4.5%。第一季度马其顿GDP增长7%，是独立17年来增长最快的季度。新政府经济政策的主要目标是改善商业环境、增加就业、提高人民生活水平、为加入欧盟做准备工作。2007年经济工作的重点是：（1）加大吸引外资力度，给投资者创造条件。当年实行了税制改革，税率降至欧洲最低，如把15%的公司税降至12%，把三种个人所得税（15%、18%、24%）统一为12%。修订贸易法，放宽要求和表格简化，注册公司由原先需要三个工作日缩短至一个工作日。（2）努力增加就业。高失业率是马其顿最严重的社会问题之一，上半年官方公布的失业率为37%，位居欧洲榜首。马其顿劳动力市场的特点是价格便宜，但劳动技能普遍不高，尤其是缺乏电力工程师和IT业的人才。针对这一问题，政府加大了对信息技术和教育的投资，制订了短期增加就业计划，争取到2010年增加13万人就业。财政部拨款50万欧元进行人员培训，并推出就业头三年免征个人所得税的新政策；经济部鼓励自我就业，免除公司注册费用，提供优惠贷款等。（3）加强出口，促进贸易平衡。上半年马其顿进出口总额为37.8亿美元，其中出口15.6亿，进口22.1亿，逆差为6.5亿美元。

在加入欧盟方面，由于执政党和反对党争吵不休，议会无法有效运作，以致遭到欧盟委员会的批评。欧盟负责扩大事务的委员奥利·雷恩指出，马其顿自2005年12月获得欧盟候选国地位以来，政治和经济改革步伐出现停滞，根据其目前的发展状况，欧盟无法考虑与其谈判的问题。

同希腊的国名之争是马其顿与邻国关系中十分棘手的问题。希腊北部有个马其顿省，希腊认为马其顿的国名暗示马其顿对这个地区有领土要求，要求马其顿使用它在1993年加入联合国时使用的“前南马其顿共和国”国名，甚至威胁，如果分歧得不到解决，将利用其北约和欧盟成员国的优势，在马其顿“加盟入约”问题上设置障碍。马其顿总统茨尔文科夫斯基表示，如果马其顿仍然无法同希腊就国名问题达成一致，马其顿可以做出一定的变通，用“前南马其顿共和国”的国名加入北约。