俄罗斯对军工军贸实行垂直管理，按管理对象可分为军工管理和军贸管理两大体系，但这两大体系之间存在着密切的联系，难以截然分开。按管理职能，可分为宏观政策、军事技术合作、国有资产管理、预算编制、国防订货、联邦专项纲要、改革与转产、投资政策、知识产权保护、劳动关系以及行政管理等诸多方面；按管理层级，分为总统决策层、总理领导层、执行权力机关层和军工军贸主体四级。

（一）总统决策层

总统是军工和军贸问题的最高领导人和最终决策人。联邦安全会议和联邦对外军事技术合作问题委员会这两个机构是辅助总统决策的重要机构。

安全会议是准备总统有关保护个人、社会和国家不受内部和外部威胁、在保障安全领域实施统一国家政策的决策的宪法机构。在国防工业管理的决策方面，安全会议主要依托下属的两个跨部门委员会工作：军事安全跨部门委员会和国防工业安全跨部门委员会。

军事安全跨部门委员会共有11项职能，其中，有4项涉及国防工业问题。根据该委员会的条例，其职能的第五项是，为联邦安全会议和总统起草有关明确武装力量、其他军队、队伍和机构的任务，改进它们的结构，优化编成和人数的建议，以及制定并执行军事经济和军事技术政策的建议；第六项是，为联邦安全会议和总统起草有关制定联邦预算草案中涉及确定保障国防和国家安全、实施国家武器纲要和国防订货的部分的建议；第七项是，按规定的程序审查有关保障军事安全问题的联邦专项纲要、实施科研和试验设计工作的最重要纲要的草案，评估其有效性，并起草给联邦安全会议和总统的相应建议；第八项是，为安全会议起草有关完善集体安全体系、明确维和活动的任务、削减和限制武装力量、核军备和常规军备、俄联邦与外国军事（军事政治）和军事技术合作问题的建议。

国防工业安全跨部门委员会的12项职能均与国防工业有关。分别是：（1）发现危险的来源并评估对国防工业潜力的内部和外部威胁；（2）预测影响国防工业潜力状况的内部和外部条件的变化；（3）制定保障国防工业安全的措施；（4）就联邦和地区一级发展国防工业潜力，包括增强动员能力和实施国防工业综合体的结构改造、对其设施进行私有化（私营化）、企业破产、组建一体化机构、根据保障国防工业安全的需要组织转产和多种经营等问题起草建议；（5）制定在保障国防工业安全领域的国家政策方向；（6）就制定并实行保障国防工业安全的国家政策的战略方针起草给安全会议的建议；（7）在制定国家工艺基础、关键基础工艺和两用工艺时，在实现国家出口潜力时找出优先方向；（8）分析国家武器纲要的实施进程和国防订货的完成过程；（9）审查为保障防务领域中的国家需求而完善科学干部和专门干部培养体系的建议；⑽审查旨在保障俄联邦国防工业安全和发展国家国防工业潜力的规范性法律文件草案的起草建议；（11）受安全会议委托，对联邦国家权力机构和联邦主体国家权力机构就国防工业安全问题的决定草案进行专家鉴定；（12）参与准备总统年度咨文和安全会议秘书向总统提交的关于保障国防工业安全的措施的报告的资料。

对外军事技术合作问题委员会是一个咨议和咨询机构，负责为国家元首制定有关俄罗斯联邦与外国军事技术合作领域国家政策的基本方向的建议。根据2000年12月1日《俄联邦与外国军事技术合作问题》总统令由原“总统下属俄联邦对外军事技术合作问题委员会”（成立于1998年12月7日，同时撤销了俄联邦对外军事技术合作跨部门协调会议）改名而来。根据2001年5月21日的总统令，对外军事技术合作委员会的成员有：总统（委员会主席），总理（委员会副主席），负责军工的副总理（委员会秘书）、负责军事技术合作的国防部副部长（委员会副秘书）、安全会议秘书、总统办公厅主任、外交部长、国防部长、对外情报总局局长、联邦安全总局局长、总统办公厅副主任兼总统对外政策局局长。委员会的基本职能是：（1）为总统起草制定并实行军事技术合作领域国家政策的基本方向的建议；（2）为总统起草有关完善军事技术合作领域联邦法律的建议；（3）分析并预测军事技术合作领域内的情况，以保障俄联邦的政治、经济和军事利益；（4）按规定的程序研究有关军事技术合作问题的联邦专项纲要草案；（5）研究军事